Bioinformatica en lekke bacteriën

Webmaster • 10 februari 2023
AMP_action_Ecoli
Foto’s van E.coli bacteriën onder een electronenmicroscoop. Boven: controlegroep. Onder: behandeld met een antimicrobieel peptide, waardoor de membraan kapot gaat en de celinhoud (groen) uit de bacterie lekt (Bron: Wikipedia, GFDL)

Voor een goede oogst is het belangrijk om gewassen gezond te houden. Chemische middelen zijn daarbij vaak effectief. Ze beschermen planten relatief gemakkelijk en goedkoop tegen ziekten en plagen. Helaas kunnen deze middelen ook schadelijk zijn voor mens en milieu. Vandaar dat er veel onderzoek wordt gedaan naar alternatieve bestrijdingsmethoden.

Antimicrobieel peptide (AMP)
Een mogelijk alternatief is de inzet van antimicrobiële peptiden tegen ziekteverwekkers bij planten. Antimicrobiële peptiden zijn korte aminozuurstrengen (in feite kleine eiwitmoleculen) die zich hechten aan de celmembraan van een schadelijke bacterie of schimmel en op die manier lekkage van de membraan veroorzaken. De ziekteverwekker overleeft dat niet.

Data analyse
Van nature leven op of rond de plant meerdere bacteriesoorten die dit soort peptiden produceren, vooral bedoeld om concurrenten uit te schakelen. De onderzoekers proberen m.b.v. data analyse en bioinformatica een bacterie te vinden die ‘het beste peptide’ produceert. En met ‘het beste’ bedoelen ze dus een peptide dat speciaal geschikt is om micro-organismen die planten ziek maken, uit te schakelen.

In de geneeskunde wordt deze techniek met antimicrobiële peptiden al soms ingezet, bijvoorbeeld bij een infectie met een antibiotica-resistente bacterie. Peptiden werken dan nog wel. De ontwikkeling van peptiden tegen plantenziekten is nu ook in gang gezet. Het zal naar verwachting enkele jaren duren voordat er een product ligt dat in de praktijk getest kan worden.

22 september 2026
De Europese ruimtevaartorganisatie ESA heeft in de nacht van 14 op 15 september de satelliet Flex gelanceerd. Deze satelliet kan in een vroeg stadium herkennen of planten op aarde gestrest zijn. Al lang voordat bomen verdorren door droogte, kan de satelliet meten dat de plant stress heeft. Hoe doet die satelliet dat? Door het meten van chlorofylfluoresecentie! Hoe werkt dat? Een plant vangt zonlicht op in het bladgroen en zet het via fotosynthese om in suikers. Maar niet alle zonlicht wordt omgezet, een deel wordt door de plant als rood of verrood licht uitgestraald. Dat heet chlorofylfluorescentie. Dus hoe minder fotosynthese, hoe meer fluorescentie. En dat kun je meten. In de video van ESA wordt het ook uitgelegd.
7 september 2026
Je katoenen onderbroek begraven voor de wetenschap.... Het wordt gedaan en is nu zelfs beloond met de Ig Nobelprijs voor een grappig, maar toch serieus onderzoek. Na analyse van duizend begraven onderbroeken ontdekten de onderzoekers dat het ondergoed het snelste vergaat in particuliere tuinen, met hoge gehaltes aan organisch materiaal. Dit is een ideale omstandigheid voor regenwormen, schimmels, bacteriën en andere bodemorganismen. Bodemorganismen blijken het minst actief te zijn in strakke gazons. En landbouwgronden en weilanden scoren daar ergens tussenin. Het bodemleven bepaalt voor een groot deel hoe gezond een bodem is en daarmee ook de gezondheid van de planten die er groeien! Benieuwd hoe het er in jouw (school)tuin of buurt voor staat met het bodemleven? Doe zelf ook het onderbroeken experiment !
10 augustus 2026
Niet alleen Trump kondigt importheffingen en handelsbeperkingen aan. Ook andere landen doen dat. Maar vaak doen ze dit niet (uitsluitend) met economische of politieke motieven. Meestal gaat het om 'fytosanitaire' maatregelen. Of simpel gezegd: het buiten de deur houden van schadelijke plantenziekten. Zo heeft China vanaf 1 augustus strenge importeisen voor aardappelen ingesteld. De reden? Het tegenhouden van de bacterie Candidatus Liberibacter solanacearum, die Zebra chip ziekte veroorzaakt. Wanneer je aangetaste aardappels in schijfjes snijdt en deze frituurt krijg je chipjes met donkerbruine strepen: een zebra-patroontje. In de Verenigde Staten en in sommige Europese landen komt de ziekte al voor. In Nederland nog niet en dat wil de NVWA graag zo houden. Meer over de Zebra chip ziekte >>
16 juli 2026
Het klinkt misschien een beetje tegenstrijdig: Veel bomen en planten bij elkaar (een bos dus) kan zorgen voor minder bosbranden. Hoe zit dat? Belangrijk is om een bos aan te planten met een mix aan verschillende soorten bomen en struiken. Dus liever niet alleen naaldbomen. Loofbomen houden relatief veel water vast in hun bladeren, de stam en in de bodem. Daardoor vatten ze minder snel vlam dan naaldbomen. Bovendien verliezen sparren en dennen bij droogte grote hoeveelheden droge naalden. Dit vormt een extra risico omdat vuur zich via brandende naalden op de bodem snel kan uitbreiden. Gemengde bossen zijn dus een stuk beter bestand tegen droogte dan een bos dat maar uit één boomsoort bestaat (monocultuur). Krijgt één soort last van de droogte? Dan zijn er in een gemengd bos nog voldoende andere boomsoorten die het bos in stand houden. Ook in je eigen omgeving kun je 'brandwerende planten' aanplanten, bijvoorbeeld inheemse struiken zoals haagbeuk of bosbes.
Bloemetjes, bijtjes en waarschuwingen voor soa’s (seksueel overdraagbare aandoeningen). Je hebt er i
9 juni 2026
Bloemetjes, bijtjes en waarschuwingen voor soa’s (seksueel overdraagbare aandoeningen). Je hebt er in de biologieles vast ook wel eens voorlichting over gehad.
bidsprinkhanen-2026_1500.jpg
door Webmaster • 30 maart 2026
Het Laboratorium voor Entomologie doet al 100 jaar onderzoek aan insecten. Reden voor een feestje en daar ben jij ook bij uitgenodigd! Er zijn in april en mei verschillende activiteiten, zoals de Insectenmarkt op 25 april met foodtrucks, kunst, wetenschap etc. en er is de tentoonstelling het Grote Belang van Kleine Beestjes. Insecten zijn onmisbaar […]